Et c'est à partir de là que Lynch se dévoile totalement, avec des films plus indépendants, intimistes. Celui-ci ne se gêne pas pour nous monter les visions de ces mondes complétement décalés !
Ainsi Blue velvet ( 1986 ) permet au réalisateur de renouer les liens entre le réalisateur, choqué par l'ampleur des critiques de Dune, et le cinéma, qui est avant tout un art.

En 1990, Sailor & Lula sort sur nos écrans, et en profite pour mettre un grosse gifle à Cannes...Lynch remporte la palme d'or avec un film coup de poing, ou ressort la violence ( musicale, physique ), l'amour et le décalage avec tout ce qui nous entoure.

Après cette réussite, un grand projet se dévoile devant nous, Twin Peaks : Fire walk with me ( 1992 ) . Le film sort après la série du même nom, mais est en fait la préface . Déroutant pour tous les spectateurs n'ayant pas vu la série, Fire walk with me ne ressort pas vainqueur face à la critique et au public, ce qui enterre le petit monde de Twin Peaks ( Sauf pour les fans).

C'est en 1995 que Lost highway sort en avant-première mondiale en France. On dit que Eraserhead est la genèse du " Lynchland ", Lost highway peut en être l'épilogue. Ce film renoue, dans tous les sens du terme, avec les sujets favoris de Lynch. D'ailleurs la seule explication que celui-ci nous donne sur le film est qu'il parle d' " une fugue psychogénique ".

Le " Lynchland " venant de se clore avec Lost highway, David Lynch s'attaque a un film plus personnel : " The straight story ", premier film ou il ne participe pas à l'écriture du scénario. Celui-ci sera sélectionné au Festival de Cannes 1999, mais ne recevra aucune récompense malgré la reconnaissance générale des critiques.

C'est en 2001 que Lynch réalise une série télévisée : Mulholland Drive. Diffusé par ABC, la chaine décide d'interrompre le projet car il y a trop d'incohérences dans le scénario (disparition de personnages sans aucunes raisons).
Lynch laisse tomber ce projet mais est recontacté par Canal + pour transformé cette série en film.
Après avoir retourné des scènes, le film est présenté au festival de Cannes 2001 et recevra le prix de la meilleur mise en scène avec le film des frères Cohen.